案例：
小陳的阿祖說他們家原本有一塊土地在南投縣竹山鎮，日治時期因為成為河川地，被當時日本政府塗銷所有權登記，後來台灣光復後，該筆土地在92年1月登記為中華民國所有，管理機關為財政部國有財產署。多年後因為地形變更，河川改道的緣故，該筆土地又浮現成為河川浮覆地。小陳想要回這塊土地，可以依土地法第12條第2項規定，直接向地政事務所申請回復所有權登記嗎？
答：
要看財政部國有財產署是否同意小陳回復所有權而定。
對於因天然變遷成為河川而成為國有的原私有土地，如經原所有權人證明為其原有而依土地法第12條第2項規定主張回復所有權時，原所有人之所有權當然回復，無待申請地政機關的核准(自動回復說)？抑或僅取得回復所有權的請求權，於行使該請求權並獲准回復登記後，始得回復其所有權（核准回復說)？最高行政法院108年度上字第688號判決啟動大法庭機制統一見解，採取自動回復說，也就是土地所有權在土地登記簿上的記載，僅是公示的方法。
但是要注意的是，申請登記如果涉及所有權爭執時，此為私權糾紛，依土地法第37條第2項所授權訂定的土地登記規則第57條第1項第3款、第3項規定，人民應該循民事訴訟程序由民事法院確定，在未經民事法院確定所有權歸屬前，登記機關即地政事務所不可以受理登記的申請。
本件地政事務所對於小陳回復所有權的申請案件，會先向財政部國有財產署詢問意見，如果財政部國有財產署同意小陳申請回復所有權，地政事務所就會實質調查申請案件是否符合土地法第12條第2項規定的各項要件，決定是否許可登記。
但是如果財政部國有財產署不同意小陳的申請，則小陳與國有財產署之間關於該筆土地的所有權，存有爭執，這個屬於私權爭議，小陳就應該要向民事法院提起訴訟，由民事法院審認土地所有權的歸屬，或者私底下跟國有財產署以訴訟外紛爭解決機制來處理。在民事法院未確定所有權歸屬前，地政機關會依土地登記規則第57條第1項第3款規定駁回小陳的申請喔！(110年5月編寫)
相關法規：
土地法
第12條
(第1項)私有土地，因天然變遷成為湖澤或可通運之水道時，其所有權視為消滅。
(第2項)前項土地，回復原狀時，經原所有權人證明為其原有者，仍回復其所有權。
土地登記規則
第57條第1項第3款、第3項
(第1項)有下列各款情形之一者，登記機關應以書面敘明理由及法令依據，駁回登記之申請：
三、登記之權利人、義務人或其與申請登記之法律關係有關之權利關係人間有爭執。
(第3項)依第1項第3款駁回者，申請人並得訴請司法機關裁判或以訴訟外紛爭解決機制處理。
私有土地因天然變遷成為湖澤或可通運之水道時，其所有權視為消滅後，嗣該土地回復原狀時，原所有權人之所有權固當然回復，無待申請地政機關之核准，則權利人自得按土地登記規則第27條第10款之規定單獨申請上開土地法第12條第2項規定之回復所有權登記以為公示，地政機關自應依「實質審查原則」，就申請案件是否該當土地法第12條第2項規定之各要件，進行實體之調查以決定是否許可登記，如該土地尚未為第一次登記，地政機關自必須本於權限作成准駁之決定。然而，該土地如業經登記為他人所有或國有時，而該登記之權利人不同意塗銷依法所為之登記者，此際即屬有前揭土地登記規則第57條第1項第3款「登記之權利人、義務人或其與申請登記之法律關係有關之權利關係人間有爭執」之情事，登記機關應以書面敘明理由及法令依據，駁回登記之申請，申請人則得訴請民事法院裁判或以訴訟外紛爭解決機制處理。
